Le niveau d'un personnage est le troisième indicateur de puissance. Pour évoluer il pourra compter sur plusieurs activités : Les tournois, les missions, les examens, les évènements.. et cetera. Il sera également un pré-requis important pour pouvoir effectuer des achats dans la zone marchande du forum, que ce soit des armes ou des jutsus. Aussi utile pour passer d'un rang à l'autre. (confer les rangs, les grades.)
Actuellement le niveau maximal est 125 et il vous faudra user de ruse et de rigueur pour y parvenir. Voici un récapitulatif des différentes façons de progresser :

Les missions : 1 à 7 niveaux
Les tournois : 2 à 6 niveaux
Les examens : 1 à 3 niveaux
Les évents : 3 à 7 niveaux

   Notez également que la progression de votre personnage est bloquée à chaque palier maximal atteint. Un genin ne pourra pas monter au-delà du niveau 10, il lui faudra pour cela passer l'examen et obtenir le grade de chûnin. Ensuite il sera bloqué à 25, il devra encore attendre de passer un examen, puis une fois atteint Jônin, le maximum est 50, puis 100 pour les forces spéciales et cetera. Il faudra donc constamment débloquer des niveaux, des rangs ou des grades via les outils mis à votre disposition pour être en constante évolution.